ระบบอาวุธปล่อยนำวิถี ของกองทัพเรือเริ่มต้นเมื่อกองทัพเรือได้สั่งต่อเรือหลวงมกุฎราชกุมาร ที่ประเทศอังกฤษ พร้อมด้วยอาวุธปล่อยนำวิถีซีแคท กองทัพเรือจึงเริ่มต้นเข้าสู่ยุคของ อาวุธสมัยใหม่ นั่นคืออาวุธปล่อยนำวิถี พร้อมกันนี้กองทัพเรือได้จัดสร้างคลัง และอาคารทดสอบขึ้นเพื่อให้ดำเนินการดูแลรักษาตรวจสอบ และซ่อมบำรุงระบบอาวุธนี้ ซึ่งเป็นภารกิจโดยตรงของกรมสรรพาวุธทหารเรือ ในการนี้กระทรวงกลาโหมจึงได้อนุมัติให้จัดตั้งหน่วยงานสำหรับรับผิดชอบงานด้านนี้โดยเฉพาะขึ้น คือ แผนกจรวดนำวิถี และคลังจรวดนำวิถี กรมสรรพาวุธทหารเรือ ต่อมากองทัพเรือได้ จัดหาอาวุธปล่อยนำวิถี ที่ทันสมัยยิ่งขึ้นเพิ่มอีก ๒ แบบคือ อาวุธปล่อยนำวิถี เกเบรียล และอาวุธปล่อยนำวิถีเอ็กโซเซท ดังนั้นเพื่อให้เหมาะสมกับปริมาณงาน และขอบเขตความรับผิดชอบที่เพิ่มขึ้น กระทรวงกลาโหมจึงได้อนุมัติจัดตั้ง กองอาวุธปล่อยนำวิถีขึ้น ในปี พ.ศ.๒๕๒๘ ซึ่งต่อมา กองอาวุธปล่อยนำวิถีได้ขยายอัตราใหม่เพิ่มเติมเพื่อรองรับอาวุธที่ได้รับเพิ่มขึ้นอีก ได้แก่ อาวุธปล่อยนำวิถีฮาร์พูน, อาวุธปล่อยนำวิถีเอสปิเด้, อาวุธปล่อยนำวิถี C-801 และ อาวุธปล่อยนำวิถี C-802A