พลเรือโท ศุภกร บูรณดิลก ผู้ช่วยเสนาธิการทหารเรือฝ่ายกำลังพล ในฐานะประธานเตรียมการจัดขบวนเรือพระราชพิธี เป็นประธานในพิธีบวงสรวงพระภูมิเจ้าที่และเซ่นไหว้แม่ย่านางเรือพระราชพิธี เมื่อวันที่ ๓๐ มีนาคม ๒๕๔๙ เวลา ๐๙.๐๙ น. ประเภทเรือรูปสัตว์ จำนวน ๖ ลำ ก่อนที่จะอัญเชิญลงจากคานลงน้ำ ณ ท่าวาสุกรี ถนนสามเสน กรุงเทพมหานคร โดยเรือพระราชพิธีทั้ง ๖ ลำ ประกอบด้วย เรือเอกไชยเหินหาว เรือกระบี่ราญรอนราพณ์ เรือสุครีพครองเมือง เรือพาลีรั้งทวีป เรือครุฑเตร็จไตรจักร และเรืออสุรปักษี
             กองทัพเรือ ได้เริ่มฝึกซ้อมฝีพายเรือพระราชพิธีตั้งแต่เดือนตุลาคม ๒๕๔๘ เป็นต้นมา ทั้งนี้เพื่อให้เกิดความพร้อมในการจัดกระบวนพยุหยาตราชลมารคได้อย่างสมพระเกียรติ โดยทำการฝึกซ้อมฝีพายในเรือ ตั้งแต่วันที่ ๖ กุมภาพันธ์ - วันที่ ๒๕ เมษายน ๒๕๔๙ ในพื้นที่ต่าง ๆ ประกอบด้วย โรงเรียนนายเรือ กองเรือยกพลขึ้นบก กองเรือยุทธการ โรงเรียนสื่อสารทหารเรือ กรมสื่อสารทหารเรือ แผนกเรือพระราชพิธี กองเรือเล็ก กรมการ ขนส่งทหารเรือ แหล่งรวมเรือวัดราชาธิวาสฯ และ อู่ทหารเรือธนบุรี กรมอู่ทหารเรือ หลังจากนั้นกองทัพเรือ จะทำการซ้อมย่อยและซ้อมใหญ่อย่างต่อเนื่อง และจะทำการฝึกซ้อมใหญ่ในเวลากลางคืนโดยจะแต่งกายเหมือนจริง จำนวน ๒ ครั้ง คือในวันที่ ๒ และ ๖ มิถุนายน ๒๕๔๙ เวลา ๑๙.๓๐ น.